Scheepvaart
Aan de zuidrand van de Klaverbank is een scheepvaartroute. Hierover worden ook gevaarlijke stoffen vervoerd. Aan de noordwestrand van de klaverbank is de hoogste scheepvaartintensiteit. Dit komt door de aanwezigheid van olie- en gasplatforms gelegen buiten het Natura 2000-gebied.
Olie- en gaswinning
Aan de zuidkant van de Klaverbank liggen enkele platforms zowel in Nederlands als in Engels water. Binnen een straal van 10 km liggen nog eens een kleine 20 boorplatforms.
Pijpleidingen en kabels
De Klaverbank wordt doorsneden door vier pijpleidingen en een telefoonkabel. De telefoonkabel loopt van Engeland naar Denemarken en is niet meer in gebruik. Het is sterk afhankelijk van de locatie van nieuwe olie- en gasboorplatforms of en waar nieuwe leidingen komen.
Monitoring
Met regelmaat bezoeken onderzoekers de Klaverbank. Zij meten onder andere de kwaliteit van het water. Ook doen zij onderzoek naar de aantallen en soorten dieren die leven in het gebied. Hiermee voldoet Nederland aan (internationale) afspraken.
Visserij
In de Klaverbank wordt vooral gevist op platvissen als tong en schol. Daarnaast maken vissers vooral jacht op vissoorten als haring en makreel. Het vissen op platvis gebeurt van oudsher vooral met boomkorkotters. Boomkorvisserij is een visserijmethode waarbij met een viskotter twee sleepnetten over de zeebodem worden getrokken. De netten woelen de bodem om. De overheid en de vissers werken aan steeds meer vormen van duurzame visserij. Daarbij is veel aandacht voor Natura 2000-gebieden.